强直性脊柱炎的疾病活动控制是医生和病友共同关注的首要问题。传统的方法如使用柳氮磺胺吡啶、甲氨蝶呤、雷公藤多甙等，虽然在一部分人身上有效，但是医生很难判断哪些人有效，哪些人无效。肿瘤坏死因子拮抗剂虽然能迅速控制疾病活动，但仍需要传统的方法维持，并且一些人还会复发。强直性脊柱炎患者要注意防止各种的感染因素。
成都京研强直性脊柱炎研究院专家表示：呼吸道感染与强直性脊柱炎的疾病活动有关，其中最主要的是肺炎衣原体和肺炎支原体，采用克拉霉素治疗70%有效，部分患者可以停药。部分使用生物制剂的患者加用克拉霉素后，疾病活动能迅速得到控制，而且能够延长生物制剂使用的间隔时间。但一些患者的效果仍然不理想。
而病毒感染是诱发强直性脊柱炎疾病活动的另一个诱发因素。
成都京研强直性脊柱炎研究院同时还指出强直性脊柱炎患者的滑膜存在大量的浆细胞(文章还未发表，不过现在应该还是国际上首次发现)，这种浆细胞在其他疾病中往往与纤维化和硬化有关，但对激素效果较好，提示强直性脊柱炎控制疾病活动应该使用免疫抑制剂和激素。但临床上单纯使用激素效果往往不好，可能与感染没有控制有关。
